TY - RPRT TI - PIGSTI: a modular, reproducible pipeline for detecting species identity, pathogens, and microbes from animal palaeogenomic data AU - L'Hote, L. AU - Butt, C. AU - Halpin, A. AU - Sacristan, L. AU - Mattiangeli, V. AU - Bangsgaard, P. AU - Yeomans, L. AU - Zeder, M. AU - Mashkour, M. AU - Davoudi, H. AU - Hansen, S. AU - Decruyenaere, D. AU - Kennedy, M. AU - Vautrin, A. AU - Begmatov, A. AU - Belinskiy, A. B. AU - Berdimuradov, A. AU - Bogomolov, G. AU - Bruno, J. AU - Kalmykov, A. AU - McMahon, J. AU - Mirzaakhmedov, J. AU - Pollock, S. AU - Rante, R. AU - Reinhold, S. AU - Richter, T. AU - Sandiboev, A. AU - Sauer, E. AU - Strolin, L. AU - Teramura, H. AU - Thomas, H. AU - Erven, J. A. M. AU - Nakagome, S. AU - Bradley, D. G. AU - Daly, K. G. PY - 2026 DO - 10.64898/2026.09.01.748539 UR - https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.01.748539v1 ID - 10.64898/2026.09.01.748539 ER -