TY - RPRT TI - OxBreaker: species-agnostic pipeline for the analysis of outbreaks using nanopore sequencing AU - Reding, C. AU - Hopkins, K. M. V. AU - Colpus, M. AU - Sanderson, N. D. AU - Gentry, J. AU - Oakley, S. AU - Campbell, M. AU - Karageorgopoulos, D. AU - Jeffery, K. J. M. AU - Eyre, D. W. AU - Bejon, P. AU - Stoesser, N. AU - Walker, A. S. AU - Young, B. C. PY - 2026 DO - 10.64898/2026.03.18.709804 UR - https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.03.18.709804v1 ID - 10.64898/2026.03.18.709804 ER -